Systém refundácie
Pri systéme refundácie sa prostriedky ESF a štátneho rozpočtu na spolufinancovanie preplácajú v pomere stanovenom na projekt na základe skutočne vynaložených výdavkov zo strany prijímateľa, t. z. prijímateľ je povinný realizovať výdavky najskôr z vlastných zdrojov a tie mu budú pri jednotlivých platbách refundované v pomernej výške.
Systém zálohových platieb
Zálohové platby sú prijímateľovi poskytované pomerne za zdroje ESF a štátneho rozpočtu nasledovne:
Na výpočet maximálnej výšky zálohovej platby je prijímateľ povinný použiť nasledujúci vzorec:
Prijímateľ po poskytnutí zálohovej platby je povinný túto zálohovú platbu priebežne, minimálne jedenkrát za dva mesiace zúčtovávať, pričom najneskôr do 6 mesiacov odo dňa pripísania finančných prostriedkov na účet prijímateľa je povinný zúčtovať minimálne 50 % z poskytnutej zálohovej platby. V prípade nezúčtovania tejto čiastky alebo jej časti je prijímateľ povinný bezodkladne, najneskôr do 5 pracovných dní od ukončenia uvedeného obdobia 6 mesiacov, vrátiť platobnej jednotke sumu nezúčtovanej zálohovej platby. V takom prípade sa o čiastku nezúčtovaného rozdielu do výšky 50 % z poskytnutej zálohovej platby znižuje výška nenávratného finančného príspevku.
Po vyčerpaní a zúčtovaní maximálne 95 % celkových oprávnených nákladov na projekt prijímateľ je povinný zostávajúcich minimálne 5 % z celkových oprávnených nákladov na projekt, uhradiť z vlastných zdrojov.
Až po preukázaní tejto úhrady a ukončení realizácie projektu je prijímateľ oprávnený požiadať o záverečnú platbu.